Pajekや他のソフトにあって、Cytoscapeに無いもの

ちょっと気が早いのですが、2.6に関することを少々。(できるだけ早めに皆さんの意見を伺いたかったので。)
ネットワーク解析ソフトでは、pajekはかなりポピュラーなもののひとつです。その人気の理由のひとつに、最初から用意されている各種解析機能があります。Cytoscapeでは、解析機能はプラグインで提供するというアプローチだったため、いまひとつどこから始めていいかわからないという意見が聞かれました。そこで、2.6から、解析機能もある程度まとめて最初から提供しようということになりました。ここで言う解析とは、グラフに関する各種オペレーション(最短経路など)、クラスター解析などを含みます。
そこでお願いなのですが、一言でかまいませんので、「このソフトのこんな機能を取り込んで」「pajekのXXという機能が便利だからCytoscapeでも使いたい」といった感じでここのコメント欄に書き込んでいただけますでしょうか?要望のあったものはできる限り実装しますので。
皆さんの意見をお待ちしております。

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