Google Summer of Code 2010に参加します

今年も無事Googleの方に受理されましたので、CytoscapeもGoogle Summer of Codeのメンター組織として参加します。詳しい事は、以下のページをご覧ください。

http://code.google.com/intl/ja/soc/

プロジェクトのアイデアは以下の様なものがあります

http://socrates2.cgl.ucsf.edu/GenMAPP/wiki/Google_Summer_of_Code_2010

学生の方々には非常に良い経験になると思いますので、是非挑戦してみてください。

応募期間が3月29日から4月9日までと非常に限られているので、参加を考えている方は今すぐ準備を!

Cytoscape 2.7 Betaテスト中です

かなり長いブランクがありましたが、Cytoscapeの新バージョン2.7を間もなくお届けできる予定です。今回の目玉機能としては、ネットワークの階層構造のサポートがあります。端的に言えば、「ネットワークのネットワーク」を作る事が出来る機能で、ネットワークを内包するノードには、ちゃんとそのネットワークの構造をレンダリングして表示する事が可能です。

現在ベータテスト中ですので、こちらからダウンロードして問題点等あればご連絡ください。

http://chianti.ucsd.edu/Cyto-2_7-beta/

日本Cytoscapeユーザーグループ

スクリーンショット(2009-12-30 11.17.36).png
今までGoogleグループで運営を行ってきましたメーリングリストですが、暫く放置してあったためにスパムの温床になってしまいました。今回、改めて設定等を見直してもう少し意味のあるメーリンスリストとして復活させようと大掃除を行いましたので、他のユーザーとの情報交換の場としてお使いいただければ幸いです。

Cytoscapeユーザーミーティングの開催 : 中止になりました

申し訳ありませんが、都合によりこのミーティングは中止になりました。


ただし、もしご希望でしたら25日の同じような時間帯に都内のカフェ等で小規模なミーティング等を持つ事は可能ですので、ご希望の方は直接メール(konoアットマークucsd.edu)いただくかTwitterでご連絡ください(Twitter Account: c_z)。


急ではありますが、ナラプロテクノロジー様が再び都内でCytoscapeユーザーミーティングを開催してくださる事になったのでお知らせいたします。


2009-12-16

Cytoscapeの大野圭一朗さんを迎えて2
Cytoscapeのユーザミーティングを開催することになりました。
日時:12月25日(金)10:00-11:00
場所:弊社(予定)、参加費:無料
参加ご希望の方は事前にここまでご連絡ください。


年末の忙しい時期ではありますが、ご興味のある方はぜひお越し下さい。

Cytoscapeユーザーミーティングのお知らせ

来週の月曜日、東大にてCytoscapeのユーザーミーティングを行うことになりました。興味のある方はぜひご参加ください。


UC, San Diegoの大野と申します。


この度、ナラプロ・テクノロジーズ株式会社様の御厚意により、東大駒場教養キャンパスにてCytoscapeのユーザーミーティングを行うことになりました。Cytoscapeとは、システム生物学分野で広く使われている、ネットワークデータ統合・解析・可視化の為のオープンソースプラットフォームです。


http://www.cytoscape.org/
http://cytoscape.seesaa.net/


私はUCSDにて、このソフトウェアのコア部分を中心に開発しております。今回は、実際にユーザーの方のご意見を伺い、今後の開発にフィードバックさせて行きたいと思っているので、こういったツールに興味のある方、もしくはもう使っていらっしゃって、質問や機能リクエストなどのある方はぜひご参加ください。


日時は8月31日(月)3時~、場所は東大駒場教養キャンパス(17号館1F 生命科学ネットワーク)となっております。ご質問等ありましたら、担当のナラプロ・テクノロジーズ櫛田様までご連絡ください:


ナラプロ・テクノロジーズ株式会社
113-0033 東京都文京区本郷2-40-17本郷若井ビル6F-B


Tel: 03-3813-6140
Fax: 03-3813-6150
kushida@nalapro.com
http://www.nalapro.com/


よろしくお願いいたします。
University of California, San Diego
School of Medicine Trey Ideker Lab
Research Associate/Programmer Analyst


Keiichiro Ono
http://chianti.ucsd.edu/~kono/profile/top.html